Custos bespeelt onder meer de volgende instrumenten:

- blokfluiten van Peter van der Poel, naar Stanesby, Debey en Ganassi
- blokfluiten van Ronald Wick, naar Denner, Heytz, Stanesby jr en Bressan
- flauti traversi van Fridtjof Aurin, naar Denner en Palanca
- flauto traverso van Simon Polak, naar Beukers
- barokhobo van Toshi Masegawa, naar Denner 
- viola da gamba van Bert Claudius en Geesje Liedmeier, naar Rombouts (1706)
- dessus de viole van Andries van Oosten
- gambastokken van Gerhard Landwehr
- clavecimbel van Fama en Raadgever, naar Andreas Ruckers (1644)
- clavecimbel van Jim Hall, naar een Frans-Vlaams instrument (ca.1690)